Các tù nhân thường bị giam ở tù một thời gian dài trước khi bản án của họ cuối cùng được thực hiện. Thông thường, kháng cáo cuối cùng của họ đã được thông qua tòa án xét xử, hai phiên tòa phúc thẩm và xem xét sự khoan hồng của Tổng thống Indonesia.

Các tù nhân và gia đình của họ được thông báo trước 72 giờ về việc xử tử.[8] Chúng thường được chuyển đến đảo Nusa Kambangan. Họ thức dậy vào giữa đêm và được đưa đến một địa điểm xa xôi (và không được tiết lộ) và bị xử tử bằng cách bắn vào đội hình. Phương pháp này đã không thay đổi kể từ năm 1964.[9][10]

Tù nhân có thể nêu rõ yêu cầu cuối cùng của họ mà công tố viên có thể đưa ra khi thấy khả thi và không cản trở quá trình xử tử.[11]

Người tù bị bịt mắt được dẫn đến một khu vực cỏ, nơi họ có một lựa chọn để ngồi hoặc đứng.[9] Những người lính vũ trang bắn vào tù nhân từ phạm vi năm đến mười mét, nhắm vào tim. Chỉ có ba viên đạn lửa và phần còn lại là lửa. Nếu tù nhân sống sót sau khi bắn, chỉ huy được yêu cầu bắn vào đầu tù nhân bằng vũ khí của mình.[12] Thủ tục được lặp lại cho đến khi bác sĩ xác nhận không còn dấu hiệu của sự sống của tù nhân.[11]